研究所下辖两个实验室：低碳能源与节能技术实验室，工业分离与环境保护实验室，其中，工业分离与环境保护实验室被评为“深圳市工业应用分离技术重点实验室”。本研究所以节能减排为目标，以促进新能源产业的发展，更好地实施国家环保战略为己任，积极、务实地开展各种相关技术、产品和设备的开发。研究所拥有一支经验丰富的由正副教授、高工、工程师以及博士后、博士、硕士等组成的技术研发团队。
       主要研发方向：
       低碳能源与节能技术实验室  锂离子电池、太阳能电池、低温热源发电技术、再生能源技术、太阳热反射与隔热节能技术、大功率LED散热节能技术、动力工程减阻节能技术、纳米材料与应用、UV功能涂料等领域的研究与产业化开发。
        工业分离与环境保护实验室  精细化学品、植物药用成分、高纯药物等高附加值产品的分离提纯、制备工艺及其设备；生物质能深度开发及生物质综合利用；水处理技术开发，如饮用水处理，工业污水处理，生活污水处理，中水回用，垃圾渗滤液处理，养殖水循环净化处理等；以臭氧技术为基础的空气净化技术开发。

    科研业绩：
        新能源与环境保护研究所先后承担了国家、省、市、粤港合作等纵向课题30多项，申报国家发明专利50多项，其中有20多项已获得授权，发表论文100多篇，20多项科研成果通过省、市级科技成果鉴定，技术处于国际先进及国内领先水平。有多项成果成功实现产业化，并已向全国推广应用，取得了良好的社会和经济效益。
    产学研合作：
        研究所注重产学研合作，广泛开展学术交流，与国内外多所著名高校、科研院所建立了合作关系，同时通过提供技术支持、共建联合研发中心等形式为企业服务，使产学研模式真正落到实处，已累计为企业解决难题30多项，对企业的技术进步起到了助推器的作用。
    人才培养与队伍建设：
        研究所充分利用清华大学和兄弟院校的学位培养平台，培养了硕士研究生10余人，利用研究院的企业博士后工作站招收并培养了博士后20多人。
目前，研究所共有各类科研人员30余人，职称结构合理，已形成较好的人才梯队，是一支生气蓬勃、勇于探索、苦干实干的科研队伍。